Office-Dateien haben meist eine Prüfsumme gegen Manipulationen außerhalb der Anwendung.
Du bist da eher gezwungen, mit MS-Project die Aufgabe durchzuführen.
Mit Excel native geht das schon gar nicht. Hierzu musst du ein VBA-Macro entwickeln, dass die Datei einliest, in die gewünschten Teile zerlegt, die bearbeitbaren Daten in ein Blatt stellt und das Ganze dann wieder als Datei zusammenführt.
Ob das Ganze dann auch klappt, sei mal dahingestellt.
Alternativ lässt sich MS-Project aber auch automatisieren, d.h., per VBA lässt sich mittels MS-Project-Objektmodell das Projekt entsprechend laden, bearbeiten und speichern (CreateObject).