Tenes dos posiblidades, una es hacer una migracion IN place, o sea actualizando el sistema operativo directamente de 2000 a 2003 , es la opcion mas rapida pero deberias dejar tu red sin servicio unas horas , (La otra opcion es que pongas alguna maquina virtual con una imagen del controlador de dominio durante el proceso de migracion iN place)
La segunda opcion es instalar el 2003 server , ponerle los parches , instalar DNS , subirlo al dominio , promoverlo a controlador de dominio, y luego pasar los roles FSMO del servidor 2000 al 2003 con ntdsutil.
http://sedelrio.spaces.live.com/blog/cns!97FB3953392E4EAD!136.entry
Slds.
Buenas practicas para el uso de los foros
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