buenas jorge.
A nivel de auditoria de Microsoft, no te va a decir nada más, a no ser de generar unos logs inmensos.
En el mercado, si que existen productos, de auditorias de cambios en los files.
En cualquier buscado, pon: "auditoria de archivos windows" y verás que te saldrán unos cuantos
Saludos y que tengas suerte.