Buenos días,
Básicamente
Recovery service vault se utiliza para backup de VM tanto de azure como locales, es decir, backup de la máquina entera.
Storage Blobs
Se utiliza para almacenar todo tipo de archivos, si tu idea es hacer backup de *.vhd y *.bak esta es tu opción. La mejor manera de subir los ficheros es utilizando Azure File Sync
Un saludo,