Vaya por delante que nunca lo he probado, así que la respuesta no tiene porqué ser correcta.
Si usas el Storage Manager for SANs (http://technet.microsoft.com/en-us/library/cc771378.aspx) quizás podrías obtener lo que deseas, aunque en tu caso es una NAS.
En algunos modelos de NAS (sóo he trabajado con las Celerra de EMC y poco menos con las EVA de HP), el control de cuotas y/o ficheros permitidos se pude administrar desde la propia NAS descargando al OS de esas tareas.
Revisa la documentación de la NAS a ver si tiene esas opciones.
Saludos,
Marc
MCSA/MCSE 2003
MCITP: Enterprise Administrator (Windows Server 2008)
MCITP: Enterprise Messaging Administrator (Microsoft Exchange 2007 & Exchange 2010)
Citrix CCA