Te recomiendo que en la sintaxis del certificado, despues de -DomainName agregues el nombre de tu servidor.
Y cuando lo habilites con el comando Import-ExchangeCertificate, al final en -services agregues tambien smtp.
Por ejemplo:
Import-ExchangeCertificate -path c:\cert.cer -friendlyname "owa.labscm.ad" |Enable-ExchangeCertificate -services "pop,imap,iis,smtp"
Saludos
Carlos Morales