La virtualización de DCs sólo está soportada en Server 2012, no en 2008 R2, por lo que no es aconsejable que lo hagas. Funcionar funciona, pero hay algunos detalles como la sincronización de tiempo o los peligros de volver a una instantánea anterior en un
DC (cosas que ya funcionan correctamente en 2012). Tanto el Host Hyper-V como los DCs virtualizados tienen que ser Server 2012.
La verdad es que, dadas las muchas ventajas que tiene Hyper-V 3 en Server 2012, si estás planteando esa migración, yo lo haría directamente sobre esta versión y no sobre Server 2008 R2.
Saludos
José Antonio Quílez
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