Hola Vero,
Efectivamente lo normal es deshabilitar el Administrator de dominio, y crear otra cuenta con permisos similares. Lo normal es hacer esto en la fase de instalación del entorno cuando aún no hay instalados otros productos.
Si ahora decides hacerlo, tendrás que tener especial cuidado con la seguridad de tus OUs, por si existe algún permiso explícito para el user Administrator y replicarlo para el nuevo. El nuevo usuario ya sabes que debes incluirlo en los mismos grupos de los
que sea miembro tu Administrator, con respecto a si afecta o no a los servicios ya desplegados no debería siempre y cuando los servicios de estas aplicaciones no estén corriendo con la cuenta Administrator del dominio (cosa no recomendada).
Te dejo esta guía de Microsoft sobre como securizar las cuentas de tu DA
https://technet.microsoft.com/en-us/library/cc700835.aspx#XSLTsection124121120120 Y este otro artículo muy interesante.
https://technet.microsoft.com/es-es/magazine/2006.01.securitywatch(en-us).aspx
Daniel Graciá - Madrid / España
MCSA 2012, MCSA 2008, MCITP Enterprise Admin
MCTS SCOM 2007, Windows Vista Configuration
MCSA 2003 + Security, MCSE 2003 + Security
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