Hola Mikent,
Aquí te dejo una guía hecha por mi que la puedes descargar cuando quieras:
Primera Guía de Instalación de Lync Server 2013 en Español
http://bit.ly/105uZZV
Además en mi blog tendrás información actualizada a diario sobre Lync Server:
http://blog.asirsl.com
En cuanto a tu pregunta, puedes instalarlo sin problemas en Windows Server 2008R2, está claro que por obsolescencia es mejor hacerlo sobre 2012, pero bueno ya es cuestión de que tengas las licencias adecuadas.
Un saludo