Hola fotorovic, todo parece indicar que si abres sin dificultad unos libros y otros no (es importante esto) los que no se pueden abrir se han dañado. A veces ocurre y posiblemente más facilmente cuando se utilizan dos versiones de Excel tan diferentes como
son la 2003 y la 2007.
La versión 2007 inició un nuevo sistema de archivos aunque, por motivos de compatibilidad, sigue trabajando con los "antiguos"
En este enlace que adjunto te explica, Microsoft, como reaparar archivos con problemas:
http://office.microsoft.com/es-es/excel-help/reparar-un-libro-danado-HA010097017.aspx
Saludos y suerte,
Xavier