Hola, no entiendo que problema estas teniendo, seria migrar los equipos + políticas al dominio nuevo?.
Imagino que tendras que "des"unir cada uno de los equipos, agregarle los dns nuevos (apuntando a los AD correspondientes) y luego unirlos al dominio nuevo.
Con los usuarios y las credenciales no vas a tener problema, ya que segun decis, se ponen las mismas claves en ambos.
Saludos!