Esto corresponde mas a los foros de programacion o de servicios de IIS. Pero así, a botepronto, te diria que no me gusta que esté allí. Easa carpetas tienes permisos espeicales. Yo en ti caso, me crearia una carpeta cilgando del raiz del disco, con los permisos especificos que neceiste el servicio y los usuarios, y dejaría allí la B.D.
Un saludo,