Hola Driank, si es posible, dentro del Failover Cluster Manager en la sección de "Services and Applications" selecciona la VM que deseas apagar, dale doble clic para
que aparezca la pantalla de "Resources" de tu VM, seleccionándola en esta pantalla y dando clic con el botón derecho tendrás la opción de apagar la VM "Shutdown..."sin que esta se reinicie.
Una opción para de realizar un respaldo en caliente es que utilices una herramienta de respaldo que soporte Volume Shadow Copies, como puede ser System Center Data Protection
Manager 2010, NTBackup, entre otras.
Saludos y suerte.
Knowledge is for share...