Hola, Jonatan:
El problema es que la version express que instala sharepoint (wss 3.0) es la version 2005 y no se si se podra migrar a sql 2000.
Te recomendaria una opcion mejor:
- desde la linea de comandos usa el programa stsadm.exe (esta en el directorio del sharepoint) con la opcion -backup
(no recuerdo la sisntaxis exacta). Esto te hara un backup del sharepoint
- instala un sharepoiint limpio, usando tu sql server. Te sirve la informacion que has encontrado en la web sobre como instalarlo
- en el nuevo sharepoint instalado vuelve a usar el stsadm con la opcion -restore, y esto te recreara tu antiguo sharepoint en el nuevo servidor, con toda tu informacion