Hola, si se puede.. tenes que hacer un backup con ntbackup y decirle que queres que te guarde la configuracion de sistema (o estado del sistema), luego reinstalar el windows, entrar en modo restauracion y levantar el backup. a mi criterio es mucho quilombo solo por reinstalar.. (solo util si se te pinchan todos los DC)
Una mejor y mas simple es tener un 2do DC, entonces reinstalas el Servidor, y luego cuando corres dcpromo se sincroniza con el 2do DC de la red. Esto seguro anda si el servidor a reinstalar no tiene los ROLES, si los tiene no se como se comporta..
te dejo un link que explica como son las diferentes forma de backups:
http://www.tech-faq.com/backing-up-and-restoring-active-directory.shtml