Hola OrlandoP como estas,
Probastes conectando un monitor directo al server ?
Recomiendo:
1 - Desde un host remoto start > run
query session /server:host
logoff /server:host id
2 - Conectar a la consola y ver el event viewer, verificar ultimos eventos con error en system y application
3 - Tener todo los updates al día
4 - Dato para alicar a 2003
http://support.microsoft.com/kb/324347/en-us
5 - Dato para aplicar a 2008
http://support.microsoft.com/kb/2740020/es
A nivel fisico:
6 - Verificar con la tool de la marca del fabricante de cada server, la temperatura a nivel hardware, estado de las fuentes y discos, avisos de upgrade y firmware, estado de suspensión de encendido y de discos, log