Windows 10 reconoce el hardware en el cual fue instalado por lo que si hiciste el cambio de tarjeta madre este supondrá que cambio y te pedirá activarlo, si es una licencia OEM cualquier cambio importante de hardware te pedira comprar una nueva licencia
de Windows 10
https://support.microsoft.com/es-es/help/20530/windows-10-reactivating-after-hardware-change
Si tu Windows es original y tienes la licencia a la mano intenta formatear el disco e instalarlo desde 0, pero lee el articulo de arriba antes.
Saludos!