Creo que te respondes en la misma pregunta. Antes del paso de envio de correo, puedes establecer una condición de comprobación del tiempo de ejecución del flujo de trabajo, y si en el momento en el que se va a enviar el correo no se
encuentra en horario laboral, estableces un tiempo de espera hasta la jornada siguiente.
Otra cosa es como esté configurado el correo electrónico en tu CRM, y si los correos van a seguir algún criterio a la hora de enviarse. Los temas de configuración los puedes ver en esta página:
http://blogs.msdn.com/b/crmlandia/archive/2009/01/02/microsoft-dynamics-crm-4-0-e-mail-router.aspx
En cualquier caso yo suelo trabajar más con tareas, por el funcionamiento interno del cliente. Espero que te ayude, saludos.