Hoy en dia ya solo deberias pensar en las versiones 3.0 que son MOSS 2007 y WSS 2007.
WSS es gratuito pero tiene algunas limitaciones en cuanto a busquedas multisitio, enlaces con otros servicios, etc.
MOSS o Office Sharepoint Server es tremendamente completo, pero es de pago.
Yo te recomendaria que empezaras con WSS y cuando tengas clara la tecnologia intentes pasar a MOSS si es que lo necesitas.
Aqui tienes una comparativa de los dos productos:
http://office.microsoft.com/en-us/sharepointtechnology/FX101758691033.aspx
Un saludo.
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Daniel Matey.
MCSE, MCSA, MCSD, MCDBA.
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