Sería bueno que el disco duro lo particionaras/formateras antes usando la herramienta gratis que da el fabricante del disco duro, no lo hagas con el mismo cd de Windows. Además en el Bios revisa si tienes el disco duro en AHCI o en IDE compatible.
Seagate
http://www.seagate.com/la/es/support/downloads/discwizard/
Western Digital
http://support.wdc.com/product/downloaddetail.asp?swid=119