Mmm... No creo que venga por ese lado, viene más por un problema de comunicación con los controladores de dominio me parece.
Inclusó recien estaba haciendo unas pruebas y vi que en ocasiones me tira un error ejecutando los comando netdom verify y nltest /SC_QUERY para verificar el secure channel contra los controladores de dominio. Pero al principio me aparecia el error y más tarde no, parece que tiene algún problema intermitente de comunicación con el AD.
Quizás lo tendría que haber posteado en la parte de servicios de directorio, pero bueno voy a seguir peleando con esto.
Saludos y gracias