SantiagoBb,
¿Como estas? Mira Windows Server 2003 Small Business Server SP2 es 32 bits y cualquier version de Windows Server 2012 es de 64 bits.
Al ser diferentes arquitecturas, no podras hacer una actualizacion onplace, es decir sobre el mismo hardware del SO, deberas realizar una reinstalacion asegurandote que el hardware del servidor soporte sistemas operativos de 64 bits.
En caso que tengas que migrar informacion, podes realizar un backup de la misma y luego una vez reinstalado con Windows Server 2012 migrarla.
Por otro lado, si tenes un Active Directory la cosa cambia, ya que deberas primero extender el esquema desde un servidor x64, y todos los pasos pertinentes para el reemplazo de domain controllers.
Saludos!
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