Hola Juan, el método nativo de Windows para proporcionar HA para ambientes virtualizados en Hyper-V es Failover Clustering, un requerimiento forzoso para crear un cluster de Hyper-V es el almacenamiento compartido.
Puesto que no cuentas con almacenamiento compartido podrías utilizar algunas de las siguientes soluciones alternas:
1) Utilizar Windows Storage Server o Starwind para crear una SAN virtual y mediante iSCSI puedas crear un cluster con los 2 servidores.
2) Realizar respaldos de tus VMs mediante SCDPM para que en caso de un desastre puedas recuperarlas (esta opción no es HA sino Backup-DRP)
3) Mediante herramientas de terceros (por ejemplo Double Take) replicar tus VMs al otro servidor aunque el proceso de failover generalmente es manual.
Espero te sea de ayuda.
Saludos y suerte.
Knowledge is for share...