Hola
Puede ser que estes abriendo un documento guardado en una versión anterior a la 2007 que solo tienen 65536 filas. La única manera que tienes de solucionar esto es guardando el documento con el formato nuevo de la versión 2007 o 2010,
lo tienes que guardar como XLSX.
Saludos.
David Asurmendi Ochoa.