Si las instalaciones fueron hechas de manera independiente con el otro disco desconectado o fuera de línea no debe aparecer el menú de arranque dual, la ultima instalación no tiene forma de ver la existente y crearlo.
Ahora habría que iniciar con el medio de instalación de Windows 7, en la primera ventana pulsar en Reparar.
Al cargar las opciones de reparación se pulsa en la primera opción "Reparar arranque" si están visibles ambos discos esto bastará para crear el menú de arranque.
Saludos cordiales. Ivan