Hola.
Depende de cómo te lo plantees. Lo principal es que la seguridad de SQL Server sea de Windows.
Luego, depende de si el acceso a SQL Server se basa en grupos o se basa un permisos a cada usuario. Si se basa en grupos, desde AD quitas o añades usuarios al grupo con acceso. Si se basa en accesos individuales, desde AD habilitas o deshabilitas
el usuario.
Mi recomendación es que operes con grupos.
Alberto López Grande (Visita mi blog en http://qwalgrande.blogspot.es/)