¿Es la edición Standard de Windows Server 2008 R2? Está limitada intencionadamente a 32 GB por motivos de licencia, ya que las ediciones Datacenter y Enterprise sí admiten hasta 2 TB.
Memory Limits for Windows Releases (MSDN)
No puedo garantizar a priori que mis respuestas sean exactas y acordes a los problemas descritos, pero por lo menos yo no las voy marcando como propuestas o definitivas sin saber si han sido útiles o no. Tampoco vinculado a Microsoft.