Teoricamente non dovresti avere problemi con 2008 R2, ma quando possibile è sempre meglio utilizzare versioni "allineate" in particolare se utilizzi gli Integration Services.
Per quanto riguarda la compatibilità documentata ho trovato purtroppo solo informazioni su SQL Server Management Studio September 2015 preview. Questa versione sembra supportare da SQL Server 2016 fino a SQL Server 2005 e presenta delle ottimizzazioni
per la compatibilità con versioni precedenti:
https://msdn.microsoft.com/en-us/library/mt238290.aspx