タイトルには、「Windows Server 2012 R2 Essentialsがインストール出来ません」とありますが、本文を拝見すると「Microsoft Security Essentials」と勘違いをされていらっしゃるのではないかと推察致しますが、いかがでしょうか？２つの製品の違いは以下の通りです。
Microsoft Security Essentials･･･ WindowsクライアントOS上にインストールし、悪意のあるソフトウェア、ウィルス、スパイウェアから保護するソフトウェア
Windows Server 2012 R2 Essentials･･･主に中小企業を中心とした環境で、ファイルサーバーやリモートアクセス、クライアントPSのバックアップ、Microsoftのクラウドサービスとの統合管理を実現するサーバーOS
Microsoft Security Essentialsがインストールできないという内容でしたら、Windows 8.1 には Windows Defenderがあらかじめ導入されており、Security Essentials は不要なためインストールできないようになっています。
参考：http://windows.microsoft.com/ja-jp/windows/security-essentials-download
お手数ですが、再度質問の趣旨をご確認頂き、もしもWindows Server 2012 R2 Essentials に関するご質問でしたら、インストールプロセスのどこでエラーが発生し、どのような画面表示がされているか情報を提供してください。
Masahiko Sada
Microsoft MVP for File System Storage http://satsumahomeserver.com/
