no79nm さん
こんにちは、
Windows Server 2008 R2 で実装されていますグループポリシーは、移行ガイドに従ってWindows Server 2012 Essentials へ移行することでグループポリシーはそのまま移行されます。
必要なポリシーのみを有効にして、不要なポリシーは削除してください。
新しくWindows Server 2012 Essentials にグループポリシーを実装することもできます。その際は、既存のグループポリシーに追加するのではなく、新しいグループポリシーを作成するようにしてください。また、対象となっているコンピューターは、WMIフィルターで制限するか、セキュリティグループで制限することもお忘れなく。