Application Initialization 機能の doAppInitAfterRestart と skipManagedModules が具体的に何をしているのか分かり難いです。
以下は、Googole翻訳結果
https://www.iis.net/configreference/system.webserver/applicationinitialization
doAppInitAfterRestart
アプリケーションの再起動が発生するたびに初期化プロセスが自動的に開始されることを指定します。これは初期化プロセスは、アプリケーションプールの再起動後に開始されることを指定するアプリケーションエレメントでpreLoadEnabled属性とは異なることに注意してください。
デフォルト値はfalseです。
skipManagedModules
初期化中にマネージモジュールをロードする(false)かどうか
デフォルト値はfalseです。
