チャブーンです。
既存環境はドメイン、という前提で回答しますが、Windows Server 2008 R2のDNSサーバは、ドメインに参加していますか?
ドメインに参加していない場合、そのサーバにアクセスして管理するためには、サーバレベルの認証が必要です。ドメインに参加させるか、(奨めませんが)ワークグループDNSのAdministratorアカウントのパスワードを、ドメインAdministratorのパスワードと同じにして、パススルーで接続してください。
上が当てはまらないなら、詳細を教えてください。