マルチキャストを扱える L3 中継装置(ルータとかL3SW)があれば、WDS でマルチキャスト展開するのが一番効率がいいでしょう。
.wim 形式を WDS にセットするのであれば、WAIK で .wim を作る事になるので、WAIK と WDS は同列のものではなく、補完する関係にあります
(まだ評価していないので良く分かっていませんが、Windows Server 2008 R2 の WDS では、.vhd を使って展開できるようです)
> また、展開前はSysprepで閉じるのが基本でしょうか?
SID が重複していると、ドメイン参加等で問題が起きますので、sysprep で SID をクリアするのが常套手段です。
sysprep すると、PnP も走りなおすので、ハードウェアに起因するブルースクリーン防止にもなります。
> NewSIDツールを利用したりしていましたが
sysprep がそれに該当します
Windows Server 2008 の情報になりますが、うちのサイトに WDS の解説を書いていますので、よろしければ参考にしてください
http://www.vwnet.jp/Windows/WS08/WDS/WDS.htm
MVP for Virtual Machine : Networking