・NTFSアクセス権はwindows2008であればicaclsであれば可能と思われます。(やったことがないのですいません。)
・共有設定は,net shareコマンドでおこないます。
・共有アクセス権は,permcopyコマンドで移行可能です。
・FSRMについては,xmlでインポート,エクスポートができますが,移行元と先のOSバージョンが一緒じゃないとできません。
バージョン違いの場合はDirQuotaを使用します。
TechNet Community Support 佐伯 玲