ShiroYuki_Mot様、回答ありがとうございます。
今回の現象ですが、正常にコマンドが実行されたのではなく、コピー先にE:ドライブを指定したにもかかわらず、C:ドライブ上のProgramDateフォルダやUsersフォルダ内のファイルを消去するという現象が発生しました。
Log上では、E:ドライブ上のファイルを消去しているように見えていたのですが、処理が進むにつれデスクトップアイコンなどが次第に消えてきたので途中で気づいてコマンドの実行を中断しましたが後の祭りでした。
理由が分からず困惑しています。