mr-r00 さん、こんにちは。
フォーラムオペレーターの三沢健二です。
その後いかがでしょうか？ 問題は解消されましたか？
mr-r00 さんの環境で発生している、Userenv ID：1000 のイベントについては、既にご存じかなとは思ったのですが、プロファイル（ハイブファイル）のアンロード時に、アプリなどによってファイルがロックされている場合に記録されるようですね。
では、どのアプリがロックしているかについてですが、まず考えられるのがセキュリティソフトだと思います。
ただ、それ以外のアプリがロックしている可能性も十分考えられるので、こちらのエラーを調査するのであれば、まずはどのアプリがロックしているのかを特定し、次になぜロックしているのかなどを調査することになると思います。（このあたりも既にご存知かもしれないんですが・・・）
ちなみに、どのアプリがロックしているかを調査するのであれば、「Regmon」 や 「Process Monitor」、あとは 「Userenv.log」 などが参考になるかもしれません。
（ただ、そこで取得したデータから、さらに詳細な調査となると、Forumのような場では解決は難しい感じはするのですが・・・・もし現象を回避する事が優先であれば、UPHClean などで回避出来る可能性があります）
ご投稿を拝見すると、発生している現象がエラーだけではないようなので、充分な情報ではないかもしれませんが、エラーの調査が糸口になるかもしれないので、こちらの情報が少しでもお役に立てれば幸いです。
（明確なお答えが出来なくてすいません、、、）
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マイクロソフト株式会社 フォーラム オペレーター 三沢健二
