確かに、そのような目的であるというのは理解できるのすがそこにＭＣＰのような資格試験が絡むとなると、という意味合いでの不公平感を感じています。
MCP は個人の知識を評価する側面もありますが、パートナーネットワークとしては MCP を取得している人数によってその会社のスキルを評価するという意味もあります。
たとえば、ある分野の MCP 取得者の数が一定以上ないと、特定のパートナーの機能・特典を利用できないなど。
MCP に何を期待しているか？なのでしょうけれども、面接で有利になるというようなものをお考えであれば、別に不公平とか考えなくてよいのでは。
パートナーな会社の経歴がないと言うことは自力で獲得したことを証明すると思います。
（もっとも、資格が取れるぐらい、その道に精通しているということを証明する資格なので、合格することがゴールではないはずです。資格を持っていることが有利と言うよりは、資格を取得できるぐらい、経験・知識が豊富であり、仕事で活かせる状態であればアピールポイントにはなりそうですが…）
逆に、パートナーな会社で勤めている場合は、MCP 取得は有利になるというより、パートナーの機能・特典を取得・維持するために、従業員に取らせないといけない ＝
義務と化す ものですし、転職時は「業務経歴」と一緒についてくるだけでしょう。
