チャブーンです。
おっしゃる資料ですが、MSの資料には以下の記述があり、「ホスト名が異なるコンピューター間」での移行を前提とした情報なので、お眼鏡にかなうように思います。
https://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/dn486797(v=ws.11).aspx
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このガイドは、ドメイン コントローラーでもある移行元サーバーから、別の名前を持つ移行先サーバーに CA を移行するために使用できます。
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移行の実行中、既存の CA (コンピューター、または少なくとも CA サービス) をオフにするように求められます。移行先 CA に対して、元の CA と同じ名前を付けるように求められます。コンピューター名 (ホスト名または NetBIOS
名) は、元の CA と一致する必要はありません。ただし、移行先 CA の名前が移行元 CA と一致する必要があります。また、移行先 CA の名前を、移行先コンピューターの名前と同じにすることはできません
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念のため申し添えますが、もし「新しいホスト名と同じ『CA名』を持つ証明機関で移行したい」ということでしたら、これはできません。証明機関の名前(CA名)は証明機関を一意性を特定するものですので、これが変わってしまう場合は別の証明機関として扱われます。CA名は確かに既存のコンピューター名を参考にして作成されますが、一度作られた場合、別のコンピューターに移行しても、前の名前でそのまま使えますし、そうする必要があります。
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