こんにちは、sm18 さん
フォーラム オペレーターの星 睦美です。
私の環境で試してみたところ、組織外の送信者からのメールは迷惑メールとなりましたが、
組織内のメールに関しては迷惑メールには入りませんでした。（ちなみに通常は「差出人セーフ リストおよび宛先セーフ リストに登録されていない送信者からの電子メールや組織外の送信者からの電子メールを信頼しない」にチェックしない設定で使用しています。）
sm18 さんのExchange Server 2010 環境の構成や、Exchange Server の設定、受信メールの送信者アカウントの情報など詳しく調査する必要がありそうですが、もしよろしければMicrosoft のサポート窓口（有償）のご利用を検討いただければと思います。
ご参考までにTechNet ライブラリから関連情報をご紹介します。
・スパム対策およびウイルス対策のメール フローについて:
http://technet.microsoft.com/ja-jp/library/aa997242.aspx
なにか手がかりになれば幸いです。
日本マイクロソフト株式会社 フォーラム オペレーター 星 睦美
