sp_benkyou さん
なるほど、そういうことですね。
SharePointのインストールそのものは、SQL Serverがどこにあってもネットワーク的につながっていれば問題ないので、これまでのご経験からインストールすることは可能かと思います。
あとは、他部門のSQL Serverとなると、間にファイアウォールがあって接続できないとか、そういう可能性があるんですかね?
いずれにしろ、SharePointインストール時に、SQL Serverの名前を正しく指定し、SharePointから見えることを確認できれば、いつも通りのインストールと変わりないと思います。
SharePoint Developer http://sharepoint.orivers.jp