以下のレジストリで実現できそうです。
HKEY_LOCAL_MACHINE
SYSTEM\CurrentControlSet\services\W32Time\Parameters
0x1 Symmetric Activeモードで同期/Windowsで実装した一定間隔での同期
0x2 Symmetric Activeモードで同期/フォールバック時に利用するNTPサーバを指定
0x4 Symmetric Activeモードで同期/RFC1305に準拠した間隔での同期
0x8 Clientモードで同期/RFC1305に準拠した間隔での同期