わかる範囲でお答えします。
ご質問の件はしたのFAQにあるようです。(MSがサポートしている方法であるかは分かりませんが。)
http://oshiete.goo.ne.jp/qa/4879539.html
思いつくのは、再度ライセンス認証が必要なこと、マイコンピュータのプロパティで見たときのプロダクトIDが変わること。Cドライブシステムファイル・フォルダの重複がおこる可能性がありCドライブの空き容量が復元された結果、ASR復元に比べて減る可能性があること。(ご自身で実際に仮想環境等で検証して確認してくださいとしか答えようがありません。)
試験問題作成委員会(http://shikenmondai.blog.shinobi.jp/)