こんにちは。
公式な情報を見つけることができなかったのですが…。 モダンUIの場合のサイトロゴは正方形であることが望ましいです。長方形の場合は長いほうに合わせてリサイズされます。 サイズは64x64のようなのですが、以下のサイトだと66x66がいいとありますね。
http://sharepoint.sdk-ltd.com/?eid=160
