チャブーンです。
この件ですが、LDAP認証というのは、ここではKerberos認証(一般的な認証)のことだと思います。LDAPS認証はサーバー単位で設定しますので、一部のドメインコントローラーのみに追加設定というのはやればできます。
ただ当然ですが、LDAPS認証したいクライアントは設定サーバーを明示的に指定する必要があります。LDAPSサーバーを状況に応じて動的に選択する方法はありません。クライアントはLDAPSルート証明書を保持している必要もあります。
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