T.A.C. さん、こんにちは。フォーラムオペレーターの鈴木裕子です(^O^)／
あまり詳しいわけではないのですが（汗）、VirtualPCのアーキテクチャに関する記事を読むと（例：http://www.computerworld.jp/topics/mws/102371.html）、
>NIC2→ホストOS→VPC→ゲストの仮想NIC→ゲストOS
という経路で通信しているのではないかなと思います。
NIC2が割り当てられたゲストOSの通信が、FireWallを有効にするとできなくなる現象については、USのForumに、ウィルスバスターではないのですが、現象としては似ているかな？という投稿はあったのですが、残念ながら回避に有効な情報ではなさそうです。。。
OneCare Firewall and MS VirtualPC 2007
http://social.microsoft.com/forums/en-US/onecarefirewall/thread/c1606786-52aa-4193-9ee5-e89a1a0fb1a8
質問者のMVP - Matthew McDermott さんは、FireWallとしてOneCareを利用していて、有効にするとゲストOSからインターネット接続ができなくなると投稿されてます（NICの直接割り当てとNATと、両方試してみてますが、どちらもダメだったと書いてありますね）。
一方、RESをしているMVP - Stephen Boots さんは「特別設定することもなくできました」というRESをされてますので、NICを直接割り当てているのかは不明ですが、できないわけではないのかなという感じもします（ただ、私が実際試したわけではないので、外していたらごめんなさい・・・）。
最終的には、10番目の投稿（回答チェックがついているものです）で、「ゲストOSのFireWallを無効にして”ping –t”を打ち、レスポンスが戻っている状態でFireWallを有効にしたが、pingは戻り続けています。原因がわかったらまた投稿します」と終わっていまして、残念ながら直接参考にはなるような情報ではなさそうかなと。
ただ、T.A.C. さんはOneCareではなくウィルスバスターをお使いで環境も違いますので、一度MVP - Stephen Boots さんのRESなどを参考に確認していただくのも良いかもしれません。
あと、ウィルスバスターの方で、プロトコルで例外設定できるのであれば、プロトコルで設定してみると、通信がVirtualPC.exeで行われているか？の点の確認に（もしかしたら）なるかもしれないと思います。
あまり参考になる情報でなくてごめんなさい。
どなたか、同じような環境をお使いの方いらっしゃいましたら、ぜひぜひコメントお願いします！
マイクロソフト株式会社 フォーラムオペレーター 鈴木裕子
