toshi_kun さん、
検索して見つかった記事をご紹介いたします。
Windowsのスクリプトタイムアウト時間。スタートアップ、シャットダウン
http://blog.putise.com/windows%E3%81%AE%E3%82%B9%E3%82%AF%E3%83%AA%E3%83%97%E3%83%88%E3%82%BF%E3%82%A4%E3%83%A0%E3%82%A2%E3%82%A6%E3%83%88%E6%99%82%E9%96%93%E3%80%82%E3%82%B9%E3%82%BF%E3%83%BC%E3%83%88%E3%82%A2%E3%83%83/
この記事を書いた人がテストした環境は Windows Server 2012 です。
グループポリシーを変更してタイムアウトの時間を変更されているようです。
私は試していないので、ご希望のことができるかは不明ですが、参考までにご紹介する次第です。
_________________
北窓舎：芦田
