情報があまりにも漠然としていますので、おそらくこの情報だけで「解決する方法」を導ける方はいないと思います。
普通に考えれば、御社で開発されているWebパーツのうち、エラーになるものには何か問題が内在している筈です。
成功しているものとの違い比較するなど、ソースレベルで見ていく必要があるのではないでしょうか?
ただ、Webでソースを公開するわけにもいかないかと思いますので、最低限「怪しい」ポイントを特定するまでは、
御社内で頑張っていただくしかないと思いますよ。
※MOSSサーバを再起動してみると上手く行ったりする場合もありますが・・・
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