未明の 3/7 に Windows Update の自動実行で KB2600217 が適用されたようなのですが、そのタイミングで、applicationHost.config の defaultDocument が書き換わってしまってました。
IIS のトップレベルでデフォルトページを規定する部分ですが、デフォルトページをない状態（defaultDocument ～がない状態）で運用してましたが、Windows Update が適用され再起動された 3/7 の 3:06 に勝手に以下の追加されてました。
<defaultDocument enabled="false">
<files>
<add value="default.aspx" />
</files>
</defaultDocument>
コンテンツの *.config で、デフォルトページを default.aspx にしてあるサイトが、重複定義のエラーを吐いてて気がつきました。
以前にも全く同じことがあり、Windows Update の適用や再起動によって必ず書き換えられるわけではなくて、.Net Framework 関係のときにのみ書き換わるのかな？と思いますが、何か詳細情報をお持ちの方おられますか？
この現象が発生するたびに applicationHost.config の中にある defaultDocument をメンテしないといけない事態に陥っております。
ちなみに applicationHost.config は直接さわっておらず、管理マネージャーでトップレベルの機能ビューの中の規定のドキュメント を使ってます。
