miyagiken さん、こんにちは。
フォーラム オペレーターの田中夢です。
こちらのご質問につきましては、まずは miyagiken さんご自身がご紹介しているサポート情報 （KB316456) に該当しているかどうかを確かめて、もしも該当しているようでしたら解決方法に記載されている内容を実施してみてはいかがでしょうか？具体的な方法につきましては、下記にご紹介するサイト（英語）に手順が記載されていましたのでよろしければご参照くださいね。
また、クラスターサーバーをご利用しているようでしたら、下記のサポート情報も参考にしていただけるかと思います。
（これらの内容を実行されるようでしたら、テスト環境でテストをしてみるなどして、ご自身の責任でお願いいたしますね。）
＜参考情報＞
- JSI Tip 6872. Windows Server 2003 ASR backup reports 'The files for the recovery diskette could not be created'?
http://www.windowsitpro.com/article/jsifaq/jsi-tip-6872-windows-server-2003-asr-backup-reports-the-files-for-the-recovery-diskette-could-not-be-created-
- バックアップ プログラムを Windows Server 2003 サーバー クラスターのパッシブ ノードで実行時に、「回復ディスクのファイルを作成できません」のエラー メッセージが表示されます。
http://support.microsoft.com/kb/899404
検索ワード：Windows Server 2003 ASR "the files for the recovery diskette could not be created"
また、原因につきましてはご利用の環境などにもよって異なってくるかと思われます。
詳細な原因の調査をご希望の場合は、弊社の有償サポート窓口のご利用もご検討いただければと思います。
こちらの情報が少しでもお役にたてば幸いです。
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日本マイクロソフト株式会社 フォーラム オペレーター 田中夢
追記：Windows Server 2003 R2 に関するご質問とのことですので、「Windows Server 2003 全般」 フォーラムに移動させていただきました。
