Olá Tadeu, bom dia.
Uma das recomendações da Microsoft para este problema não ocorrer é:
Observação: Se você quer evitar a criação de
contatos duplicados ao importar contatos, selecione
Não importar duplicatas ou Substituir duplicatas por
itens importados no Assistente de Importação e
Exportação.
Referência Microsoft:
http://office.microsoft.com/en-us/outlook-help/resolve-or-delete-duplicate-contacts-HP010355041.aspx
Como a situação já ocorreu não vejo outra forma a não ser excluir manualmente os itens duplicados.
Outro ponto clicando em Arquivo - Opções - Contatos - deixe habilitado a opção Verificar se há duplicatas ao salvar novos contatos dessa forma você evitará problemas futuros.
Espero ter ajudado.
Hezequias Vasconcelos
